Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms