Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC4BQ9NT99 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms