Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DUOX2Q9NRD8 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DUOX2Q9NRD8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms