Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms