Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HHIPQ96QV1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms