Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms