Protein–RNA interactions for Protein: Q96JK4

HHIPL1, HHIP-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPL1Q96JK4 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HHIPL1Q96JK4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HHIPL1Q96JK4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HHIPL1Q96JK4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HHIPL1Q96JK4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HHIPL1Q96JK4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HHIPL1Q96JK4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HHIPL1Q96JK4 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HHIPL1Q96JK4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HHIPL1Q96JK4 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HHIPL1Q96JK4 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HHIPL1Q96JK4 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HHIPL1Q96JK4 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HHIPL1Q96JK4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HHIPL1Q96JK4 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HHIPL1Q96JK4 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HHIPL1Q96JK4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HHIPL1Q96JK4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HHIPL1Q96JK4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HHIPL1Q96JK4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HHIPL1Q96JK4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HHIPL1Q96JK4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HHIPL1Q96JK4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HHIPL1Q96JK4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HHIPL1Q96JK4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HHIPL1Q96JK4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HHIPL1Q96JK4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HHIPL1Q96JK4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HHIPL1Q96JK4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HHIPL1Q96JK4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HHIPL1Q96JK4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HHIPL1Q96JK4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HHIPL1Q96JK4 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HHIPL1Q96JK4 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HHIPL1Q96JK4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HHIPL1Q96JK4 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HHIPL1Q96JK4 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HHIPL1Q96JK4 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HHIPL1Q96JK4 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HHIPL1Q96JK4 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HHIPL1Q96JK4 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HHIPL1Q96JK4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HHIPL1Q96JK4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HHIPL1Q96JK4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HHIPL1Q96JK4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HHIPL1Q96JK4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HHIPL1Q96JK4 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms