Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVE6

TMEM171, Transmembrane protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM171Q8WVE6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM171Q8WVE6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms