Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC21AQ8NDW8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TTC21AQ8NDW8 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
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