Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP31Q70CQ4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
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