Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
TRAF7Q6Q0C0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF7Q6Q0C0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms