Protein–RNA interactions for Protein: Q5TH69

ARFGEF3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF3Q5TH69 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms