Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDK2Q58EX2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms