Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms