Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TTLL9Q3SXZ7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms