Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZFHX3Q15911 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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