Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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