Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PICALMQ13492 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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