Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGB3BPQ13352 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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