Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
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