Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FMODQ06828 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FMODQ06828 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FMODQ06828 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FMODQ06828 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FMODQ06828 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FMODQ06828 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FMODQ06828 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FMODQ06828 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FMODQ06828 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FMODQ06828 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FMODQ06828 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FMODQ06828 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FMODQ06828 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FMODQ06828 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FMODQ06828 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FMODQ06828 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FMODQ06828 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FMODQ06828 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FMODQ06828 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FMODQ06828 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FMODQ06828 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FMODQ06828 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FMODQ06828 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FMODQ06828 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FMODQ06828 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FMODQ06828 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FMODQ06828 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FMODQ06828 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FMODQ06828 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FMODQ06828 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FMODQ06828 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FMODQ06828 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FMODQ06828 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FMODQ06828 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FMODQ06828 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FMODQ06828 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FMODQ06828 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FMODQ06828 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FMODQ06828 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FMODQ06828 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FMODQ06828 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FMODQ06828 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FMODQ06828 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FMODQ06828 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FMODQ06828 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FMODQ06828 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FMODQ06828 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FMODQ06828 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FMODQ06828 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FMODQ06828 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FMODQ06828 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FMODQ06828 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FMODQ06828 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FMODQ06828 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FMODQ06828 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FMODQ06828 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FMODQ06828 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FMODQ06828 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FMODQ06828 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FMODQ06828 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FMODQ06828 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FMODQ06828 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FMODQ06828 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FMODQ06828 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FMODQ06828 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FMODQ06828 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FMODQ06828 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FMODQ06828 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FMODQ06828 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FMODQ06828 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FMODQ06828 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FMODQ06828 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FMODQ06828 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FMODQ06828 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FMODQ06828 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FMODQ06828 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FMODQ06828 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FMODQ06828 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FMODQ06828 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FMODQ06828 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FMODQ06828 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FMODQ06828 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FMODQ06828 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FMODQ06828 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FMODQ06828 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FMODQ06828 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FMODQ06828 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FMODQ06828 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FMODQ06828 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FMODQ06828 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FMODQ06828 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FMODQ06828 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FMODQ06828 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FMODQ06828 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FMODQ06828 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FMODQ06828 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FMODQ06828 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FMODQ06828 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FMODQ06828 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms