Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms