Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BACE1P56817 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BACE1P56817 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BACE1P56817 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BACE1P56817 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BACE1P56817 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BACE1P56817 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BACE1P56817 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BACE1P56817 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BACE1P56817 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BACE1P56817 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BACE1P56817 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BACE1P56817 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BACE1P56817 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BACE1P56817 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BACE1P56817 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BACE1P56817 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BACE1P56817 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BACE1P56817 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BACE1P56817 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BACE1P56817 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BACE1P56817 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BACE1P56817 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BACE1P56817 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BACE1P56817 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BACE1P56817 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BACE1P56817 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BACE1P56817 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BACE1P56817 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BACE1P56817 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BACE1P56817 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BACE1P56817 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BACE1P56817 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BACE1P56817 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BACE1P56817 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BACE1P56817 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BACE1P56817 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BACE1P56817 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BACE1P56817 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BACE1P56817 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BACE1P56817 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BACE1P56817 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BACE1P56817 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BACE1P56817 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BACE1P56817 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BACE1P56817 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BACE1P56817 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BACE1P56817 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BACE1P56817 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BACE1P56817 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BACE1P56817 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BACE1P56817 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BACE1P56817 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BACE1P56817 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BACE1P56817 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BACE1P56817 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BACE1P56817 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BACE1P56817 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BACE1P56817 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BACE1P56817 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BACE1P56817 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BACE1P56817 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BACE1P56817 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BACE1P56817 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BACE1P56817 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BACE1P56817 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BACE1P56817 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BACE1P56817 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BACE1P56817 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BACE1P56817 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BACE1P56817 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BACE1P56817 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BACE1P56817 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BACE1P56817 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BACE1P56817 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BACE1P56817 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BACE1P56817 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BACE1P56817 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BACE1P56817 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BACE1P56817 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BACE1P56817 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BACE1P56817 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BACE1P56817 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BACE1P56817 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BACE1P56817 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BACE1P56817 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BACE1P56817 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BACE1P56817 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BACE1P56817 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BACE1P56817 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BACE1P56817 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BACE1P56817 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BACE1P56817 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BACE1P56817 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BACE1P56817 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BACE1P56817 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BACE1P56817 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BACE1P56817 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BACE1P56817 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BACE1P56817 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms