Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP98P52948 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP98P52948 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP98P52948 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP98P52948 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP98P52948 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP98P52948 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP98P52948 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP98P52948 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP98P52948 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP98P52948 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP98P52948 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP98P52948 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP98P52948 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP98P52948 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP98P52948 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP98P52948 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP98P52948 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP98P52948 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP98P52948 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP98P52948 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP98P52948 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP98P52948 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP98P52948 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP98P52948 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP98P52948 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP98P52948 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP98P52948 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP98P52948 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP98P52948 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP98P52948 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP98P52948 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP98P52948 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP98P52948 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP98P52948 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP98P52948 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP98P52948 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP98P52948 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP98P52948 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP98P52948 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP98P52948 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP98P52948 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP98P52948 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP98P52948 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP98P52948 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP98P52948 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP98P52948 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP98P52948 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP98P52948 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP98P52948 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP98P52948 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP98P52948 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP98P52948 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP98P52948 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP98P52948 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP98P52948 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP98P52948 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP98P52948 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP98P52948 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP98P52948 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP98P52948 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP98P52948 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP98P52948 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP98P52948 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP98P52948 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP98P52948 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP98P52948 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP98P52948 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP98P52948 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP98P52948 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP98P52948 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP98P52948 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP98P52948 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP98P52948 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP98P52948 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP98P52948 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP98P52948 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP98P52948 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP98P52948 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP98P52948 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP98P52948 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP98P52948 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP98P52948 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP98P52948 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP98P52948 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP98P52948 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP98P52948 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP98P52948 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP98P52948 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP98P52948 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP98P52948 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP98P52948 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP98P52948 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP98P52948 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP98P52948 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP98P52948 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP98P52948 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP98P52948 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP98P52948 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP98P52948 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms