Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms