Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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