Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMC1P11047 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMC1P11047 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms