Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms