Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSVO60911 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSVO60911 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSVO60911 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSVO60911 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSVO60911 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSVO60911 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSVO60911 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSVO60911 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSVO60911 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSVO60911 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSVO60911 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSVO60911 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSVO60911 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSVO60911 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSVO60911 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSVO60911 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSVO60911 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSVO60911 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSVO60911 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSVO60911 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSVO60911 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSVO60911 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSVO60911 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSVO60911 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSVO60911 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSVO60911 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSVO60911 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSVO60911 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSVO60911 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSVO60911 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSVO60911 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSVO60911 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSVO60911 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSVO60911 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSVO60911 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSVO60911 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSVO60911 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSVO60911 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSVO60911 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSVO60911 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSVO60911 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSVO60911 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSVO60911 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSVO60911 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSVO60911 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSVO60911 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSVO60911 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSVO60911 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSVO60911 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSVO60911 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSVO60911 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSVO60911 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSVO60911 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSVO60911 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSVO60911 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSVO60911 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSVO60911 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSVO60911 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSVO60911 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSVO60911 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSVO60911 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSVO60911 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSVO60911 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSVO60911 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSVO60911 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSVO60911 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSVO60911 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSVO60911 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSVO60911 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSVO60911 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSVO60911 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSVO60911 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSVO60911 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSVO60911 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSVO60911 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSVO60911 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSVO60911 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSVO60911 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSVO60911 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSVO60911 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSVO60911 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSVO60911 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSVO60911 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSVO60911 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSVO60911 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSVO60911 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSVO60911 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSVO60911 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSVO60911 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSVO60911 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSVO60911 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSVO60911 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSVO60911 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSVO60911 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSVO60911 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSVO60911 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSVO60911 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSVO60911 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSVO60911 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms