Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MAP3K4Q9Y6R4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MAP3K4Q9Y6R4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms