Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZCCHC17Q9NP64 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms