Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
VN1R3Q9BXE9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VN1R3Q9BXE9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms