Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDF4Q9BRK5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms