Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 AL357833.2-202ENST00000413757 372 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 UCHL1-AS1-202ENST00000510073 451 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 NOVA1-209ENST00000547619 947 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 AC135178.5-201ENST00000602597 674 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 AP000280.1-201ENST00000624800 832 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 SUGT1P3-205ENST00000633814 572 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 AL392088.1-201ENST00000428364 670 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 AC117500.1-201ENST00000497352 755 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHF12Q96QT6 TBCA-202ENST00000380377 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms