Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRIQ1Q96JM4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
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