Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDK5RAP3Q96JB5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms