Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED3Q96IU2 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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