Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAAF4Q8WXU2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms