Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z408

CSMD2, CUB and sushi domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSMD2Q7Z408 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSMD2Q7Z408 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms