Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM5Q71RC9 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms