Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD1Q6UXZ0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms