Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FRMPD1Q5SYB0 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms