Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CEP78Q5JTW2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms