Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms