Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNC3Q14003 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms