Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF9Q13886 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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