Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LAMC2Q13753 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LAMC2Q13753 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LAMC2Q13753 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LAMC2Q13753 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LAMC2Q13753 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LAMC2Q13753 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LAMC2Q13753 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LAMC2Q13753 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LAMC2Q13753 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LAMC2Q13753 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LAMC2Q13753 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LAMC2Q13753 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LAMC2Q13753 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LAMC2Q13753 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LAMC2Q13753 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LAMC2Q13753 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LAMC2Q13753 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LAMC2Q13753 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LAMC2Q13753 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LAMC2Q13753 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAMC2Q13753 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAMC2Q13753 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAMC2Q13753 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LAMC2Q13753 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms