Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

Predictions only

Length 3,056 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATMQ13315 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATMQ13315 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATMQ13315 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATMQ13315 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATMQ13315 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATMQ13315 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATMQ13315 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATMQ13315 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATMQ13315 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATMQ13315 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATMQ13315 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATMQ13315 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATMQ13315 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATMQ13315 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATMQ13315 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATMQ13315 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATMQ13315 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATMQ13315 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATMQ13315 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATMQ13315 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATMQ13315 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATMQ13315 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATMQ13315 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATMQ13315 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATMQ13315 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATMQ13315 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATMQ13315 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATMQ13315 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATMQ13315 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATMQ13315 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATMQ13315 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATMQ13315 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATMQ13315 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATMQ13315 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATMQ13315 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATMQ13315 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATMQ13315 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATMQ13315 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATMQ13315 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATMQ13315 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATMQ13315 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATMQ13315 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATMQ13315 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATMQ13315 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATMQ13315 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATMQ13315 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATMQ13315 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATMQ13315 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATMQ13315 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATMQ13315 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATMQ13315 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATMQ13315 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATMQ13315 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATMQ13315 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATMQ13315 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATMQ13315 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATMQ13315 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATMQ13315 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATMQ13315 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATMQ13315 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATMQ13315 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATMQ13315 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATMQ13315 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATMQ13315 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATMQ13315 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATMQ13315 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATMQ13315 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATMQ13315 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATMQ13315 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATMQ13315 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATMQ13315 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATMQ13315 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATMQ13315 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATMQ13315 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATMQ13315 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATMQ13315 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATMQ13315 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATMQ13315 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATMQ13315 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATMQ13315 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATMQ13315 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATMQ13315 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATMQ13315 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATMQ13315 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATMQ13315 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATMQ13315 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATMQ13315 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATMQ13315 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATMQ13315 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATMQ13315 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATMQ13315 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATMQ13315 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATMQ13315 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATMQ13315 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATMQ13315 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATMQ13315 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATMQ13315 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATMQ13315 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATMQ13315 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms