Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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