Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL1Q08397 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms